呼吸ケアはSMAにおいて非常に重要です。呼吸筋の筋力低下は、呼吸や咳を妨げ、感染症のリスクを高めます。呼吸ケアには、非侵襲的（ひしんしゅうてき）ケアと侵襲的（しんしゅうてき）ケアがあります。

非侵襲的ケアとは、侵襲的治療（次項を参照）への移行を遅らせるものです。人工呼吸器や二相性陽圧換気（BIPAP）装置などの専用装置は、口や鼻を覆うマスクから肺に持続的に気流を送り込むことができます。咳や分泌物排出を介助する器械を、自宅で使用することもできます。

侵襲的ケアとは、気管内チューブを口から挿入するか（挿管（そうかん））、または頚部（けいぶ）から直接気管に小切開（気管切開）を行うことによって、肺への気道を確保することです。

SMAのある子どもは、呼吸のみならず、噛んだり飲み込んだりする能力が弱くなることがあります。すると、食べ物や飲み物が誤って肺にはいり、誤嚥性（ごえんせい）の呼吸器感染症がおこるリスクが生じます。必要な栄養や水分をとるために、一時的または長期的に栄養チューブを胃や腸にいれることも選択できます。

栄養チューブには一般に2タイプ（経鼻チューブと胃ろうチューブ）あります

経鼻チューブ（NG）は、鼻から挿入して、直接胃に栄養を送ります。一般に、栄養チューブを必要とする期間が短い子どもに使用します。簡単に交換できます。

胃ろうチューブ（G）は、手術により腹部の皮膚を通して直接胃にチューブを挿入します。メンテナンスは比較的簡単で、長期にわたって栄養サポートを必要とする子どもの選択肢となります。

                                                                                                                              脊柱側弯症（脊椎の湾曲）は筋力低下によっておこるもので、SMAのある子どもではよくおこる問題です。整形外科医は、姿勢サポート（装具）または手術を勧める場合があります。

                                                                                                                 SMAのある子どもは、体を動かすための筋力が弱すぎて、そのままにすると筋肉や関節のこわばり（筋拘縮（きんこうしゅく）、関節拘縮（かんせつこうしゅく））がおこり、体を動かせなくなる可能性があります。理学療法では、柔軟性や全般的運動機能の改善に役立つ運動療法を行います。骨強度の向上や、股関節や膝関節、足関節の柔軟性を維持するために立位器具を自宅で使用することもあります。